多罗那他，至尊多罗那他于1575年诞生在前藏卡章地方，父名南杰彭措，母叫多杰吾嘎拉毛。4岁时，由觉囊寺座主堪钦隆热嘉措认定他是本寺前任座主更噶卓却的转世，迎人觉囊寺坐床。8岁时举行出家仪式，起名更噶宁布扎西坚赞。先后依止强巴伦珠、嘉央衮噶坚赞、吉仲·衮噶贝桑、塔钦·隆热嘉措等上师学习经论。
他学习本派的大中观他空见和有关时轮灌顶、续释、六支加行等修法外，还遍闻了其他教派诸法。另外，他先后向数名印度瑜伽师求授甚深教法和内外明处声明学等。20岁时，他的根本上师衮噶扎西坚赞给他授近圆戒，2l岁依师命住持觉囊寺。他受梦中启示，自己命名“多罗那他”，意为“解脱怙主”。从此，他开始做出许多利益教法和众生的大事业。
至尊多罗那他广闻博识，显密圆通，著述等身。他的《印度佛教史》提供了重要的史料，地位极高。根据第二佛笃布巴大师所说觉囊派意趣，对显密教法和了义大中观作了继承和发展，对本派历辈事业诸多仪轨奉命完成。
在藏巴汗彭措南杰的支持和资助下，至尊多罗那他于1624年开始创建寺院庄园。寺院建成后起名为“达丹丹曲林寺”，意为“了义欢乐园”。寺院规模宏大，仅院内占地面积达近4万平方米，院中心以高大的集会殿为主体，周围布以16座小拉康，还有印经院及僧舍。建筑形式与坛城相似。其他附属建筑多建于外围，然后再向山上发展，最后在山顶修建了土布坚拉康等，历时12年。
土布坚拉康即观音是达丹丹曲林寺地位最显赫的建筑，观音殿共五层，第三层为殿堂，原塑有高大的观音像，据说像内藏有至尊多罗那他的灵骨。如果站在观音殿门口俯览，山下的集会殿建筑群尽收眼底。达丹丹曲林寺与觉囊寺、昂仁寺曾是觉囊派的重要道场。
至尊多罗那他以后，法嗣继承人次第为贡噶仁钦嘉措、洛追南杰、恰隆哇，阿旺赤列、阿旺丹增南杰。洛追南杰应娘波恰达等许多康区人恳请，于1657年8月抵达壤塘确吉寺，受到洛卡哇·嘉哇僧格等人的盛情接待，在康区居住了20年，做了许多有利于教法东移和利益众生的大事。
1683年，五世达赖喇嘛已于上一年圆寂，第悉桑结嘉措借五世达赖名义号令西藏，将达丹丹曲林寺易名噶丹彭措林寺，觉囊派在西藏所有寺院被改宗格鲁派，此后本派主要宗见中观他空见在西藏绝传，仅是修法传承还在继续。为此觉囊派法统从后藏转移到康区，而真正实现这一转移使命的是多罗那他亲传弟子恰隆哇之侄阿旺丹增南杰。