觉囊寺的创建人为域摩.弥觉多杰的五传弟子衮邦.突结尊追(1243-1313年)创建，全名为“觉魔囊 寺”，简称“觉囊寺”。衮邦原为八思巴国师的弟子，觉囊寺初为萨迦寺之分寺，后因其不同宗见讲时轮教授，遂自从萨迦分出，另成一派。於是在西藏佛教史上形 成了一个非常有影响的教派，即“觉囊派”。
觉囊寺原有36柱子的二层楼大殿，藏式平顶的四层楼拉让(居室)德瓦建新康各一座，还有拉康、僧舍、大佛塔等，但在文革时，均被破坏，寺内文物散失。 据《青史》载：该截是由笃补巴住持觉囊寺时建的。建造此塔后获新的解悟(即“他空见”) 乃作诗一首，其中有“此如立山以穿海”之句。文革中被毁，1987年重建，该塔占地面积约1000平方米，坐西朝东，板长夯层结构。共有11层楼，20 柱、20角，108个门，108间小佛殿。第层楼外都有一圈走廊、护栏、盤旋而上。
第一层主供笃补巴和响铜制造的尊胜塔五座，以及大量佛书和该派师祖海著。墙上绘有释迦牟尼等壁书；第二层主供强巴佛、莲花生大师，墙上绘有十一面观间和燃灯佛壁书。第三层供鎏金铜铸的四臂观音菩萨五尊，墙上绘有十六罗汉及九世班禅曲吉尼玛的壁书。11层为时轮殿，墙上绘有时轮金刚像336尊。